Episoma tipleri ve özellikleri



bir episoma, Genetik alanında, konukçu hücrenin sitoplazmasında özerk olarak kopyalayabilen ve konukçu kromozomuna fiziksel olarak entegre olan bir DNA molekülüdür. ).

Bu nedenle, bu epizom bir tür varolma şekli olarak yorumlanabilir, ancak bir replikon türü olarak yorumlanamaz. Aslında, bazı yazarlar için transpozonlar ve yerleştirme dizileri, sitoplazmada hiçbir zaman bağımsız ve özerk bir varlığa sahip olmamasına rağmen, gerçekten de konakçı hücrenin kromozomu üzerinde taşındıkları için, epizomlar olarak kabul edilebilir..

Ökaryotik hücrelerde, epizom, aksine, enfekte olmuş hücrelerde plazmit olarak bulunan viral replikonlara, konakçı hücrenin genomuna entegre edilebilecek virüslere göre daha çok şey ifade eder..

Aynı kelimenin ökaryotlarda ve prokaryotlarda farklı anlamlara geldiği tek örnek bu değildir (örneğin, dönüşüm terimi). Epizomlar, modern genetiğin gelişiminde zengin bir tarihe sahiptir, çünkü kalıtımla ilgili ilginç olayları çözmeye yardımcı olurlar..

indeks

  • 1 Bakteriyofaj olan epizomlar
  • 2 Plazmid olan epizomlar
  • 3 Ökaryotik hücrelerde epizomlar
  • 4 Sonuçlar
  • 5 Kaynakça

Bakteriyofaj olan epizomlar

Klasik epizom örneklerinden biri, en iyisi Escherichia coli olan ev sahibi bakterisindeki bakteriyofaj lambdadır. Bir bakteriyofaj (kısaltılmış faj) bakterileri enfekte eden bir virüstür.

Bakterinin fajla enfeksiyonuna elverişli koşullar altında, sitoplazmaya lineer bir molekül olarak sokulan viral genom, dairesel hale getirilebilir ve spesifik sitenin rekombinasyon olayları ile konakçı bakterinin kromozomuna entegre edilir.

Faj genomu içerisinde, bakterinin dairesel kromozomundaki (attB) bir bağlanma yerine mükemmel şekilde tamamlayıcı olan kısa bir nükleotit sekansı (att) bulunur..

Bu iki bölge arasındaki rekombinasyon olayı, daha büyük bir daireye yol açan iki daire arasında bir eşbütünleşme oluşumuna yol açar. Bakterilerin kromozomu çoğaltıldığında, virüsün genomu çoğalır (epizom durumunda)..

Bu, sonsuz nesiller için gerçekleşebilir - endüktif bir olay, viral genomun bölünmesine yol açmazsa ve daha sonra, üretilen yeni viryonları salmak için bakterilerin parçalanmasında sonlanan virüsün otonom replikatif döngüsüne girer..

Plazmid olan epizomlar

En iyi bilinen epizom örneklerinden bir diğeri de doğurganlık faktörü veya plazmid F'dir. Bazen, konakçı bakterinin nükleotit yapısına bağlı olarak (örneğin, E. coli), dairesel plazmid, kromozom üzerinde mevcut olan homolog sitelerle yeniden birleşir. bir eşbütünleşmeye neden olan bakterilerin.

Yani, plazmid, bakterilerin sitoplazmasında düşük kopya sayısında çoğalabilir veya bütünleştirilirse, F (genellikle bir) olmayan bakterilere karşılık gelen sayısız kopyada bir bütün olarak çoğalabilir..

Bir epizom durumunda, F bakterilere konjugasyon işleminden sonra yüksek sayıda rekombinant üretme kabiliyeti verir.

Bu elementin yerleştirilmesine maruz kalan bir F + bakterisinin (otonom bir plazmid F'ye sahip olan) yani Hfr olduğu söylenir (yüksek rekombinasyon sıklığı ile, İngilizce olarak kısaltması için), çünkü bir konjugasyon olayı nedeniyle, teorik olarak Tüm bakteri kromozomunu "F" (yani doğurganlık faktörü veya plazmid F) bakteri içermeyen "sürükleyebilen".

Genel olarak, F plazmit ve bakteriyel kromozom arasında homoloji (ve dolayısıyla benzerlik ve tamamlayıcılık) sağlayan diziler, kointegrate yol açan spesifik bölge rekombinasyon işlemini doğrulamak için ekleme dizileridir..

Ökaryotik hücrelerde epizomlar

Tarihsel nedenlerden ötürü, epizom (üst + vücut) terimi, her zaman prokaryotlarda ekstrakromozomal elementlerin dünyasından türetilen plazmid ile ilişkili olmuştur..

Ökaryotlarda benzer elemanlar bulunurken, prokaryotlardaki plazmidlerinkine benzeyen özelliklere sahip bu tür enfekte olmuş hücrelerde kendi kendini çoğaltma yeteneğine sahip virüs genom moleküllerinin belirlenmesi için kullanılmıştır..

Yani, virüslerle enfekte olmuş ökaryotik hücrelerde, bazı durumlarda, çoğaltma döngülerinin bir parçası olarak virüsün, hücrelerde, örneğin bakterilerde tarif edilen diğer replikonlara benzer dairesel bir DNA molekülü olarak bir arada var olduğunu görebiliriz..

Otonom replikasyonun dairesel DNA molekülleri olarak bir arada bulunabilen en yaygın virüsler (konakçı kromozomdan), Herpesviridae, Adenoviridae ve Polyomaviridae familyalarına aittir..

Bununla birlikte, bunların hiçbiri, konakçı genomuna entegre edilmemiştir - bu nedenle plazmidler olarak çoğaltılması düşünülebilir ve bir epizomu karakterize eden içsel kaliteyi karşılamazlar: konakçının genomuna entegre olur.

Terimin kaldırılması önerilmiş olsa da, bu yalnızca kendi başına oldukça karmaşık bir konuya kafa karışıklığı ekleyebilir..

sonuçlar

Kısacası, etimolojik olarak konuşabilen bir epizomun, hücrede serbest bir DNA molekülü olarak bir arada var olabilen veya konakçı ile fiziksel olarak bütünleşebilen genetik bir otonom replikasyon elementi olduğunu söyleyebiliriz.

Bununla birlikte, genetik bakış açısından, bir epizom, prokaryotların genomuna entegre edilebilen bir plazmid veya bir virüstür veya bir ökaryotik hücrenin barındırabileceği plazmit türlerinden biri olabilir.

İlginç bir şekilde, ökaryotik konağın (retrovirüs) genomuna yerleştirilebilecek virüsler, epizomlar olarak kabul edilmez..

referanslar

  1. Brock, T. D. 1990. Bakteriyel Genetiğin Ortaya Çıkışı. Cold Spring Harbor Laboratuvar Basın. Cold Spring Harbor, MA, Amerika Birleşik Devletleri.
  2. Griffiths, A.J.F., Wessler, S.R., Carroll, S.B. ve Doebley, J. Genetik Analizlere Giriş. W. H. Freeman & Co, McMillan Yayıncıları. Londra, İngiltere.
  3. Hayes, W. 1971. Bakterilerin Genetiği ve Virüsleri, İkinci Baskı. Blackwell Bilimsel Yayınları.
  4. Jacob, F. ve Wollman, E.L. 1958. Lezbiyenler, elementlerin başlaması. Paris'te Rendus de l'Académie des Sciences Yarışması, 247 (1): 154-156.
  5. Levy, J.A., Fraenkel-Conrat, H. ve Owens, O. S. 1994. Viroloji, 3. Baskı. Prentice Salonu. Englerwood Cliffs, NJ, Amerika Birleşik Devletleri.