Firmicutes özellikleri, morfolojisi, filogeni ve sınıflandırılması

Firmicutes Bakterilerin sınıflandırıldığı kenarlardan biridir. Bu filum, üç sınıf (Bacilli, Clostridia ve Erysipelotrichia), 26 aile ve 223 cins içerir, böylece ana bakteri filumunu oluşturur..

Bu filumda sınıflandırılan bakterilerin ortak bir evrimsel geçmişi vardır. Hepsinde, Firmicutes isminin türetildiği sert bir hücre duvarı vardır (Latince firmus  sağlam ve ten cilt veya hücre duvarına bakın). 

Kenardaki tüm bakteriler hücresel duvarda murámico asit içerir ve bazıları toitoik asit içerir. Gram negatif olan Veillonellaceae ve Syntrophomonadaceae familyası dışındakilerin çoğu gram pozitif.

Firmicutes bakterileri fenotipik olarak çeşitlidir, küresel hücreler, düz, eğriler, helisel çubuklar veya filamentler, flabella içeren veya içermeyen, ısıya dayanıklı endosporlar içeren veya içermeyen küreseldirler..

Aerobik, fakültatif veya katı anaeroblar olabilirler. Bazıları termofilik ve / veya halofiliktir. Bazıları chemoganotroph'lar ve diğer anoksik fotoheterotroflardır. Çoğu nötr pH'ta büyür, ancak bazıları asidofilik veya alkalofiliktir. Genellikle% 50'den az olan bir DNA içeriğine sahiptirler..

Firmicutes filumunda sınıflandırılan bakteriler, filum Bakteriyodetlerinde sınıflandırılanlarla birlikte, insan bağırsak florasının önemli bir bölümünü oluşturur. Son çalışmalar, insanların ve obez hayvan modellerinin bağırsak mikrobiyotasının, Bakteriyotes ile ilgili olarak, artan Firmicutes bolluğu ile ilişkili olduğunu belirlemiştir..

indeks

• 1 Genel özellikler
  • 1.1 Filogeni
• 2 Sınıflandırma
  • 2.1 Sınıf Clostridia
  • 2.2 Sınıf Erysipelotrichia
  • 2.3 Fesleğen Sınıfı
• 3 Gastrointestinal mikrobiyota
• 4 Kaynakça 

Genel özellikler

filogenisi

Firmaların fillojisi, yeni evrim hipotezleri önermemize izin veren daha fazla veri ve yeni yöntemler içeren, sürekli revize edildi ve yeniden incelendi..

Ribozomal RNA'nın nükleotit sekanslarının küçük alt birimlerinin analizine dayanan son çalışmalar, Firmicutes filumunun üç sınıftan (Basilli, Clostridia ve Erysipelotrichia), 26 aileden ve 223 cinsinden oluştuğu filogenetik bir çerçeve oluşturmuştur..

Daha önceki sınıflandırmalarda, bu filum, Molidutes adı verilen ve Firmicutes bakterilerinin geri kalanından farklı olarak sert hücre duvarlarından yoksun olduğu, peptidoglikanlar veya muramik asit içermeyen diğer hücre sınıflarından farklı olan, ilave bir sınıf içerdiği için esnek ve oldukça pleomorfik hücrelerdir..

Bu grup, daha yakın tarihli çalışmalarda alternatif belirteçlerle Firmicutes'dan çıkarıldı. Sonuç olarak, Mollicutes sınıfı Tenericute kenarına yükseltildi.

Daha önce gram-pozitif hücre duvarı oluşturan Mollicutes'da sınıflandırılan Erysipelotrichaceae familyası, tek bir düzen (Erysipelotrichaceae) içeren tek bir düzen (Erysipelotrichales) içeren Erysipelotrichia adlı yeni bir sınıf olarak Firmicutes'da tutulur. Son analizler, Basilli ve Clostridia sınıfları arasındaki ayrımı desteklemektedir.

sınıflandırma

Clostridia Sınıfı

Clostridia sınıfı fenotipik, fizyolojik ve ekolojik olarak çeşitli bir polifiletik klattır. Hem gram-pozitif hem de gram-negatif bakteriler içerir ve çoğu cinse, istisnalar dışında spor oluşturucudur. Clostridium.

Clostridia sınıfı Clostridial, Halanaerobial ve Thermoanaerobacterales siparişlerinden oluşmaktadır. Clostridiales derecesine ait bakteriler katı anaeroblardır, Halanaerobial düzenindeki olanlar halofiliktir ve Thermoanaerobacteriales grubunun termofilik olduğu.

Bazı Clostridia türleri, fermantasyon işleminin son ürünü olarak solvent üretmek için kullanılan endüstri için büyük öneme sahiptir.. 

Diğerleri gibi toksinler üretir Clostridium botulinum, BoTox olarak da bilinir, cilt kırışıklıklarını azaltmak için yüz kaslarını felç etmek.

Erysipelotrichia sınıfı

Bu sınıf, uzun filamentler oluşturma eğiliminde olan düz veya hafif kavisli ince ince çubuklar şeklindeki bakterilerden oluşur. Endospor üretmeyen gram pozitif hücre duvarları ile hareketsizdirler..

Bunlar aerobik, fakültatif anaerobiktir. Kemoorganotrofiktirler. Fermantatif bir solunum metabolizması var. Bu grup, aralarında memeliler ve kuşlar için bazı patojenik türleri içerir. Erysipelothrix rhusiopathiae ve Bulleidia extructa.

Fesleğen sınıfı

Basilli sınıfının bakterileri genellikle gram-pozitif hücre duvarı oluşturur. Endosporları oluşturabilir veya oluşturmayabilirler. Çoğu aerobik veya mikroaerofiliktir, sadece birkaç tanesi fakültatif anaerobtur. Bacilli Sınıfı, Bacillales ve Lactobacillales siparişlerinden oluşur..

İstisnalar olmasına rağmen çoğu Bacillales düzeni cinsi endosporları oluşturur. Ayrıca, genç hücrelerde hücre duvarının gram-pozitif boyanmasına sahiptirler. Çoğu cinsiyette menaquinone 7 (MK-7) var.

MK-6'dan MK-11'e kadar olan uzun zincirlerin penkinononları, termokasinositik familyada bildirilmiştir. Menaquinones ayrıca K vitamini olarak da bilinir.₂. 

Yan zincirlerin sayısı, her bir menaquinonun özel adı ile belirtilir (örneğin, MK-6, bir kinon halkası tarafından oluşturulan molekülün çekirdeğine bağlı altı moleküler birime sahiptir).

Bacillales cinsi gibi yüksek derecede patojenik bakteriler içerir Bacillus anthracis, şarbona neden olur. Diğer önemli türler Bacillus subtilis, Hücre farklılaşmasından demir depolanmasına ve DNA replikasyonuna kadar çeşitli konuları anlamak için araştırmada model olarak kullanılan organizmalardan biri.

Lactobacillales takımından bakteri bir çubuk veya hindistancevizi şekline sahip olabilir, hücre duvarının gram-pozitif boyanmasına sahip olabilir, endosporları oluşturmaz ve çoğunlukla fakültatif anaerobik ve katalaz negatifdir.

Bu düzen, örneğin Lactobacillus, Gastrointestinal floranın insanlarda ve diğer hayvanlarda önemli bileşenleri olup, yoğurt ve diğer fermente gıdaların üretiminde geleneksel ve endüstriyel olarak kullanılır.

Gastrointestinal mikrobiyota

Gastrointestinal mikrobiyota, enerji, besin ve immünolojik koruma sağlayarak insan sağlığını korumada önemli bir rol oynar. Sağlıklı yetişkinlerde, esas olarak Bacteroidetes, Firmicutes ve Actinobacteria'ya ait 1250'den fazla bakteri türü tanımlanmıştır..

Genel olarak, Firmicutes / Bacteroidetes ilişkisinin, insan bağırsak mikrobiyotasının bileşiminde büyük önemi olduğu düşünülmektedir. Obez kişilerde yüksek oranda Firmicute tespit edilmiş, düşük ağırlıklılarda ise ters ilişki bildirilmiştir..

Bu mikrobiyotanın bileşimi, erken çocukluktan yaşlılığa kadar yaşam boyunca gelişir. Böylece, Firmicutes / Bacteroidetes ilişkisi doğumdan erişkinliğe doğru bir artış gösterir ve ileri yaşla birlikte daha da değişir.

Diyetin gastrointestinal mikrobiyota üzerinde de önemli bir etkisi olduğu tespit edilmiştir. Firmicutes / Bacteroidetes oranı, hayvansal protein ve doymuş yağ bazlı diyetlere sahip bitkilerde, bitki ve liflerde yüksek diyet içerikli olanlara göre daha yüksektir..

referanslar

1. Bahl, H & Dürre, P. (2000). Clostridia: Biyoteknoloji ve Tıbbi Uygulamalar. Almanya. Wiley-VCH.
2. Conlon, M.A. ve ve Kuş. A.R. (2015). Diyet ve Yaşam Biçiminin Gut Microbiota ve İnsan Sağlığına Etkisi. Besin Değerleri, 7 (1), 17-44.
3. Firmicutes. (2018, 30 Ocak). Vikipedi, özgür ansiklopedi. Danışma tarihi: 20:40, 27 Eylül 2018, en.wikipedia.org adresinden
4. Firmicutes. (2018, 17 Eylül) Vikipedi, Özgür Ansiklopedi. En.wikipedia.org adresinden 20:41, 27 Eylül 2018 tarihinde alındı
5. Mariat, D, Firmesse, O., Levenez, F, Guimarães, VD, Sokol, H, Doré, J, Corthier, G ve Furet JP. (2009). İnsan mikrobiyosunun Firmicutes / Bacteroidetes oranı yaşla birlikte değişmektedir. BMC Mikrobiyolojisi, 9: 123.
6. Sen, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H., Whitman, W. (2009). Bergey'in Sistematik Bakteriyoloji El Kitabı: Cilt 3: Firmicutes. Amerika Birleşik Devletleri.