Bacteroidetes genel özellikleri, sistematik, bağırsak mikrobiyotası

bacteroidetes Bakterilerin sınıflandırıldığı kenarlardan biridir. Bu kenar dört sınıftan oluşur (Bacteroidia, Flavobacteria, Esfingobacteria ve Citofagia ) ve dünyadaki her tür habitatı kolonileştirmiş 7.000'den fazla farklı tür.

Topraklarda, aktif çamurda, çürüyen bitki materyalinde, kompostta, okyanuslarda, tatlı suda, alglerde, süt ürünlerinde ve hastalıklı hayvanlarda bulunurlar. Ilıman, tropik ve kutupsal ekosistemlerde dağıtılır. bacteroidetes Açık habitatlarda izole edilenler başlıca Flavobacteria, Sitophagia ve Sphingobacteria sınıflarına aittir..

Bacteroidetes, insan bağırsak sisteminin ve diğer memelilerin ve kuşların önemli bir parçasıdır. İnsanlarda, immün sistemin aktivasyonuna ve beslenmeye, önemli bir enerji kaynağı oluşturan konakçı tarafından yeniden emilen yan ürünler üreten polisakkaritlerin ve karbonhidratların parçalanması yoluyla müdahale ederler..

Bacteroidetes phyllo türleri genus dışında çoğunlukla patojen değildir Bacteroides, fırsatçı patojenler ve insanlar, diğer memeliler, tatlı su balıkları veya deniz balıkları için patojen olan bazı Flavobacteriaceae'den oluşur..

indeks

• 1 Genel özellikler
• 2 Sistematik
  • 2.1 Sınıf I. Bacteroidia
  • 2.2 Sınıf II. Flavobacteriia
  • 2.3 Sınıf III. Sphingobacteriia
  • 2.4 Sınıf IV. Cytophagia
• 3 Bağırsak mikrobiyota
  • 3.1 Karşılıklılık
  • 3.2 Safra asitlerinin metabolizması
  • 3.3 Enerji yakalama
• 4 Kaynakça

özellikleri genel

Bu filumda sınıflandırılan bakteriler ortak bir evrimsel tarihe ve geniş bir morfolojik, fizyolojik ve ekolojik çeşitliliğe sahiptir. Kısa veya uzun çubuklar, düz, fuziform veya ince filamentler olabilirler. Gram negatifler ve endospor oluşturmazlar.

Fakültatif anaerobik veya kesinlikle aerobik olabilirler. Hareketsiz, işaretli olabilir veya kaydırarak hareket edebilirler.

Fermentatif metabolizmaya sahip bazı türler olmasına rağmen kemoorganotroflar, aerobik veya solunum metabolizması ile facultativ anaerobiktirler..

Sistematiği

Kenar bacteroidetes, grup olarak da bilinir Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides, Dört sınıftan oluşur: Bacteroidia, Flavobacteria, Esfingobacteria ve Citofagia, bu grup 7000'den fazla farklı tür.

Önceki sınıflandırmalarda, Bacteroidetes phylum, üç sınıftan (Bacteroidia, Flavobacteria ve Sphingobacteria) oluşuyordu. Bununla birlikte, 16S rRNA geninin sekans analizine dayanan daha yeni çalışmalar, bu filum, sitophajide dördüncü bir sınıfın oluşumunu haklı gösterir..

Bu yeni sınıf, Flexibacteraceae, Flammeovirgaceae ve Crenotrichaceae familyalarında önceden sınıflandırılmış birçok cinsi içerir. Bu nedenle, Bacteroidetes phylum, iyi tanımlanmış en az dört filogenetik grup içerir.

Sınıf I. Bacteroidia

Bu sınıf Bacteroidales adı verilen tek bir sipariş içerir. Şu anda sipariş beş aileyi içeriyor: Bacteroidaceae, Marinilabiliaceae, Porphyromonadaceae, Prevotellaceae ve Rikenellaceae.

850'den fazla türde temsil edilmektedir. Bu sınıfın hücreleri gram-negatif boyanma ile doğrusal, iğ biçimli veya ince kokobakillerdir. Spor oluşturmazlar.

Bunlar esas olarak anaerobiktir, ancak bazıları fakültatif olarak anaerobiktir. Proteinleri ve diğer substratları parçalayabilmelerine rağmen, fermantasyon ürünü olarak butirat üreten basit karbonhidratları fermente ederler. Kaydırılarak mobil değildirler veya mobildirler..

II. Sınıf Flavobacteriia

Flavobacteriia sınıfı, Flavobacteriales adı verilen tek bir düzen içerir. Şu anda sipariş üç aile içermektedir: Flavobacteriaceae, Blattabacteriaceae ve Cryomorphaceae. Bu, 3.500'den fazla türü gruplandıran en büyük bakteri türevi filum sınıfıdır..

Hücreler, sporları oluşturmayan çubuklar veya filamentlerdir, gaz vezikülleri ve hücre içi granüller olmadan gram negatifdir. Genellikle ikili fisyon ile çarpılır.

Blattabacteriaceae familyasının üyeleri, böceklerin hücre içi sembiyomerleridir. Flavobacteriaceae ve Cryomorphaceae familyaları, fermentatif metabolizmaya sahip bazı türler olmasına rağmen, solunum metabolizmasına sahip aerobik veya facultative anaerobik kemoorganotrofik bakterilerden oluşur.

Mobil değiller. Bu ailelerin birçok üyesi, büyüme için NaCl veya deniz suyu tuzlarına ihtiyaç duyar..

Flavobacteriaceae familyasının üyeleri toprakta ya da ılıman, tropikal ya da kutupsal bölgelerde taze, acı ya da deniz suyunda yaygındır, Cryomorphaceae familyasının üyeleri ise çok düşük sıcaklıktaki deniz yaşam alanlarıyla sınırlıdır.

Flavobacteriaceae familyasının bazı üyeleri insanlar, balıklar veya amfibiler için patojendir.

Sınıf III Sphingobacteriia

Bu sınıf sadece üç aileyi (Sphingobacteriaceae, Chitinophagaceae ve Saprospiraceae), 29 cins ve 787 türü gruplayan Sphingobacteriales siparişini içerir..

Bu tür bakteriler çubuk şeklindedir. Hareketli değiller, spor oluşturmuyorlar, gram negatif boyama yapıyorlar. Aerobik veya fakultatif anaerobik büyüme.

Bazı üyelerde sınırlı fermantasyon kapasiteleriyle. Esas olarak bazı türler Sphingobacterium, hücresel lipid bileşenleri olarak yüksek konsantrasyonlarda sfingosfolipidler içerir.

Sınıf IV. Cytophagia

Bu sınıf sadece sıra Sitophalgales ve sıra olarak muamele gören bazı diğer filogenetik grupları içerir Incertae Sedis, onları tam olarak bu sınıflandırma içine yerleştirememeyi belirtmek için.

Bu sınıfın hücreleri kısa, uzun çubuklar veya filamentler olabilir. Bazı cinsler, S şeklinde halkalar, halkalar veya hücreler oluşturur. Bunlar cins dışında sporlar üretmezler. Sporocytophaga. Kaydırarak veya hareket etmeyerek hareketlidirler. Flagella ile tek cins Balneola. Gram negatif boyama.

Büyüme genellikle kesinlikle aerobiktir, ancak bazı üyelerde mikroaerobik ve anaerobik büyüme meydana gelir. Kemoorganotrofiktirler. Doğada yaygın olarak dağılmışlardır..

Bazı cinsler, büyümeleri için deniz suyu tuzları gerektiren deniz organizmalarıdır. Çoğu tür mezofiliktir, ancak psikofilik ve termofilik üyeler vardır..

Gut mikrobiyota

Bacteroidetes, insanlarda gastrointestinal sistemin farklı kısımlarını kolonize etti. Ayrıca, ekinodermler, fareler, köpekler, domuzlar ve ruminantlar gibi diğer memelilerin mikrobiyotalarında da bulunurlar; tavuk, hindi, kaz ve devekuşu gibi yerli ve yabani kuşların; ve miltler ve termitler gibi omurgasızlarda.

karşılıkçılık

Çoğu Bacteroidetes, misafirleriyle karşılıklılık ilişkisine sahiptir. İnsanlarda, T hücre aracılı cevapların aktivasyonunu üreten bağışıklık sistemi ile etkileşime girer ve potansiyel patojen bakterilerin kolonizasyonunu kontrol eder.

Bu bakteriler genellikle antineoplastik özelliklere sahip ve bu nedenle bağırsak sağlığının korunmasında önemli bir rol oynayan fermantasyonun nihai ürünü olarak bütirat üretir..

Safra asidi metabolizması

Ayrıca safra asitlerinin metabolizmasına ve toksik ve / veya mutajenik bileşiklerin dönüşümüne de katılırlar. Polisakkaritlerin kalın bağırsakta parçalanmasına katkıda bulunur, moleküller, memeliler tarafından parçalanması zor, sindirim enzimlerinin etkisine dirençli.

Bakterilerin aracılık ettiği bu polisakaritlerin fermantasyonu, konakçı tarafından yeniden emilen kısa zincirli uçucu yağ asitlerinin (özellikle asetat, propiyonat ve bütirat) salınmasına yol açar. Bu nedenle, bu bağırsak bakterileri, konağın refrakter karbonhidrat kaynaklarından enerji elde etmesine yardımcı olur..

Enerji yakalama

Her yerde yaşayan memelilerde, özellikle insanlarda, bu ek enerji kaynağı günlük ödeneğin% 7 ila% 10'unu temsil eder.. 

Sıçanlarda, mikropsuz hayvanların dışkı içinde normal emsallerinden% 87 daha fazla kalori tükettiği ve vücut ağırlıklarını korumak için% 30 daha fazla gıda almaları gerektiği gösterilmiştir..

 Bu nedenle, diyetten en iyi enerji alımı için bağırsak mikrobiyotasının varlığı gereklidir.

referanslar

1. Hahnke, R.L., J.P. Meier-Kolthoff, M Garcia-Lopez, S. Mukherjee, M Huntemann, N.N. Ivanova, T. Woyke, N.C. Kyrpides, Hans-Peter, K. ve M. Göker. (2016). Bacteroidetes'in Genom Bazlı Taksonomik Sınıflaması. Mikrobiyolojide Sınırlar, 7: 2003.
2. Wikipedia katılımcıları. Bacteroidetes [çevrimiçi]. Wikipedia, Özgür ansiklopedi, 2017 [danışma tarihi: 10 Ekim 2018]. Es.wikipedia.org adresinde mevcuttur.
3. Johnson, E.L., Heaver, S.L., Walters, W.A. ve Hukuk, R.E. (2017). Mikrobiyom ve metabolik hastalık: Bakteriyel filum Bacteroidetes tekrarı. Moleküler Tıp Dergisi, 95 (1): 1-8.
4. Krieg, N.R., J.T. Staley, D. R. Brown, B. P. Hedlund, B.J. Paster'i N.L. Ward, W. Ludwig ve W.B. Whitman. (2010) Sistematik Bakteriyoloji Bergey'in El Kitabı: Cilt 4: Bacteroidetes, spiroket, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, fibrobacteres, Fusobacterium, Dictyoglomi, gemmatimonadetes, lentisphaerae, Verrucomicrobia, klamidyalar ve planctomycetes. Amerika Birleşik Devletleri.
5. Thomas, F. Hehemann, J.H., Rebuffet, E., Czjzek, M. ve Michel, G. 2011. Çevresel ve Gut Bacteroidetes: Yiyecek Bağlantısı. Mikrobiyolojide Sınırlar 2: 93.